При помощи ИИ CRISPR смог по-настоящему отредактировать геном

225

При помощи ИИ CRISPR смог по-настоящему отредактировать геном

Ученые из Массачусетского технологического института разработали вычислительную систему, которая предсказывает исход репарации последовательностей ДНК после ее подрезания белком Cas9. Результаты своей работы они опубликовали в журнале Nature.

Работа системы генного редактирования CRISPR-Cas9 основывается на белке Cas9 и короткой затравке определенного сегмента генома. Однако это система лишь вносит двухцепочный разрыв в ДНК, а не редактирует его. При этом со временем ген восстанавливается, но его функционирование может быть нарушено.

Для решения этой проблемы и расширения возможностей CRISPR ученые создали алгоритм, который будет предсказывать исход от репарации ДНК. В качестве обучения нейросети, которую назвали inDelphi, были использованы данные о разрезании белком Cas9 более двух тысяч сайтов ДНК.

Результаты показали, что алгоритм помог удалить последовательность с мутацией в ДНК, после чего он смог благополучно восстановиться без негативных последствий в 60% случаев.